在探讨酒醋的化学性质之前，对酿酒化学过程的了解是非常有必要的。酿酒起始于公元前3000-4000年，大部分是通过葡萄发酵酿成。但酒也同样可以从其它水果和谷物酿造，例如大米。原料质量对酒质的影响是非常重要的，因为它需要10%-24％的高糖含量和 0.5%-1.5％低酸度的酒石酸。较高的酸性能抑制酵母发酵，酒精发酵是利用酵母菌所产生的酶对果汁中的糖进行分解而成（此汁指的是经过榨碎含有果汁、种子和果皮的葡萄），这种酒精发酵（有20种酶蛋白、3-8种有机和无机辅脢参与发酵）能够产生多种物质：乙醇、二氧化碳、多酚类物质、有机香料化合物、异味化合物

苹果酸的乳酸发酵是在酵母发酵结束后进行，这种发酵过程被称为苹果酸-乳酸发酵，利用乳酸菌将苹果酸转化为乳酸和二氧化碳。

乳酸菌也能改变酒的果香味，并通过自身新陈代谢可增添一些香料化合物。但大多数酒味来自于酒精发酵的结果，酒味在储存期间会继续改变。

    一般情况下，一种标准的酒包括：水、乙醇、单宁酸、多酚类物质、香料化合物或颜色（如果来自红葡萄的酿造）

多酚类物质对酒的苦味和涩味起作用，独特香味与酒的醇熟有关。酒醋的主要原料是酒。

目前，醋是由种类繁多的各物质制成，但基本要求是这些物质应当含有足够数量的酒精和特定的香味。通过醋酸菌把酒精转化为醋酸，如下所示：

2 CH3CH2OH + 2 O2 --- > 2 CH3COOH + 2 H2O

即：乙醇+氧气--- >醋酸+水

根据文献，醋酸菌仅对酒中的酒精含量起作用，而对其它成分不起作用。酒醋的有机化学和其他文献表明，酒醋的色泽和香气依旧是用于制作酒醋的原料即酒的特性。我们可以推导出如下针对酒醋的公式：酒（乙醇+酒香+酒色+氧）--- >醋酸+水+酒香+酒色

因此，在制作酒醋过程中，醋酸菌对酒香和酒色不起作用。这些香气和颜色还是留存在酒醋中，在制作过程中，它们并未参与任何化学反应。从化学角度来看，酒醋仍然含有同样的东西。我们未发现任何研究或文献指出酒香和酒色在酒醋制造中衍变成其它物质（即发生化学反应变成新的物质）

这就意味着非清真酒的部分成分存在于酒醋中，除上述外，把酒转化为酒醋的加工过程也不是100%，少量的酒也会余留在酒醋中。根据圣训，醉人产品量少跟量多均是非法的。根据伊玛目沙菲尔教法学派，认为酒醋是不清真的；但根据伊玛目艾布·哈尼法教法学派，认为酒醋是洁净的；根据艾乃斯·伊本·马利克解释，先知穆罕默德并未允许从酒中酿造醋。